了解唯一双标签(UDI)与相关建库试剂盒
使用唯一双标签策略有助于在Illumina测序平台上获得最高的文库测序和拆分准确性。 当准备进行多个不同文库合并测序时,Illumina鼓励客户尽可能使用唯一双标签(UDI),以确保最准确的样本拆分。
关于唯一双标签,您需要了解的是:
唯一双标签是一种测序策略,每一个i5和i7都是独特的,不重复的标签序列。
唯一双标签是一种缓解标签错误分配的方法,可以过滤下游分析中发现的标签跳跃序列。错误分配的序列将被标记为“不指定样本的序列”,并且可以从分析中去除。 有关标签跳跃的更多信息,请参阅标签错误分配对数据拆分和下游分析的影响。 更多减低标签跳跃的最佳操作请在此处查阅。
唯一双标签或非重复标签是在文库构建流程中标签加入步骤被引入的,文库构建流程无需进行任何更改。
组合双标签,位于同一块96孔板上每个i5和i7标签在行和列之间有重复,不同样本会共享其中一端的标签。 尽管双标签组合是唯一的,但是每个单标签会有重复。
与组合双标签相比,唯一双标签具有完全独特的标签序列(例如,每个96孔板含有96个独特的i5和96个独特的i7)。
图1: 组合双标签,位于同一块96孔板上每个i5和i7标签在行和列之间有重复,不同样本会共享其中一端的标签。 尽管双标签组合是唯一的,但是每个单标签会有重复。与组合双标签相比,唯一双标签具有完全独特的标签序列(例如,每个96孔板含有96个独特的i5和96个独特的i7)。
以下UDI试剂盒适用于不同的文库构建流程:
TruSeq Unique Dual Index 试剂盒
Product Name | Catalog Number | Indexes, Samples |
IDT for Illumina - TruSeq DNA UD Indexes | 20020590 | 24 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina - TruSeq DNA UD Indexes | 20022370 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina - TruSeq RNA UD Indexes | 20020591 | 24 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina - TruSeq RNA UD Indexes | 20022371 | 96 Indexes, 96 Samples |
TruSeq DNA UDIs 与建库试剂盒 TruSeq DNA PCR-Free, TruSeq DNA Nano 及 TruSeq DNA Exome 兼容
TruSeq RNA UDIs 与建库试剂盒 TruSeq Stranded mRNA 及 TruSeq Stranded Total RNA 兼容
IDT for Illumina DNA/RNA Unique Dual Index, Tagmentation 试剂盒
Product Name | Catalog Number | Indexes, Samples |
IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation1 | 20027213 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation2 | 20027214 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes Set C | 20027215 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes Set D | 20027216 | 96 Indexes, 96 Samples |
以上四款index试剂盒与建库试剂盒 Nextera XT, Illumina DNA Prep3 和 Illumina DNA Prep with Enrichment4 兼容
The IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-B (20027213, 20027214) 与 Illumina RNA Prep with Enrichment 和 Illumina DNA PCR-Free 试剂盒兼容
IDT for Illumina RNA Unique Dual Indexes, Ligation 试剂盒
Product Name | Catalog Number | Indexes, Samples |
IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A, Ligation | 20040553 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina RNA UD Indexes Set B, Ligation | 20040554 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina RNA UD Indexes, Ligation 试剂盒与 Illumina Stranded Total RNA 和 Illumina Stranded mRNA 试剂盒兼容
请注意这个试剂盒包含 IDT for Illumina DNA/RNA UD Index 板及 RNA Index Anchor 板。其中 RNA Index Anchors 的使用在与之兼容的流程中是必须的
IDT for Illumina UMI DNA/RNA Unique Dual Indexes, Ligation 试剂盒
Product Name | Catalog Number | Indexes, Samples |
IDT for Illumina UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation | 20035701 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation | 20034702 | 96 Indexes, 96 Samples |
IDT for Illumina UMI DNA/RNA UD Indexes 试剂盒与 TruSight Oncology 500 High-Throughput 试剂盒兼容
请注意这个试剂盒中包含 IDT for Illumina DNA/RNA UD Index 板和 UMI DNA Index Anchor 板,其中 UMI DNA Index anchors 的使用在与之兼容的流程中是必须的
Ampliseq for Illumina Unique Dual Index 试剂盒
Product Name | Catalog Number | Indexes, Samples |
AmpliSeq UD Indexes for Illumina | 20019104 | 24 Indexes, 24 Samples |
AmpliSeq UDIs 试剂盒与所有的 AmpliSeq for Illumina 建库试剂盒兼容
完整的illumina接头序列请参阅 Illumina 接头序列文档,完整的Illumina index产品组合请参阅 Illumina adapter portfolio 文档,唯一双标签与组合双标签的比较请参阅双标签介绍网页
1Formerly known as IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes Set A
2Formerly known as IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes Set B
3Formerly known as Nextera DNA Flex
4Formerly known as Nextera Flex for Enrichment
For any feedback or questions regarding this article (Illumina Knowledge Article #7133), contact Illumina Technical Support techsupport@illumina.com. |
Last updated