Illumina测序平台上每个测序步骤的运行时间预测
Illumina测序的运行时间包括簇生成、边合成边测序化学循环、双端化学反应和清洗步骤。此外，使用非Pattern模式的flow cell的运行在构建模板时会暂停一段时间。为了帮助规划测序工作流程和预测整体运行时间，表1根据Illumina测序平台和试剂版本总结了每个测序步骤的预估时长。
仪器
测序仪器上簇生成
每个循环的时间(分钟)
模板构建暂停时间*
双端测序反转时间
运行后清洗/维护清洗
iSeq 100
5小时
2.2
N/A
52 分钟
无需清洗
MiniSeq
90分钟
3.5
运行继续
60 分钟
75分钟
MiniSeq
(快速运行)
整体运行时间：
单index, 1x 101 -5.1小时
双index, 1x 101 -5.7小时
N/A
运行继续
N/A
N/A
MiSeq v2
60分钟
Nano = 2.5
Micro = 3
Full = 4.5
运行继续
31 分钟
运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟
MiSeq v3
70分钟
6
运行继续
50 分钟
运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟
MiSeq i100系列
~ 120分钟
~ 1分钟
N/A
~ 60 分钟
N/A
NextSeq 500/550 (中通和高通试剂)
2.5小时
4.6
运行继续
60 分钟
90分钟
NextSeq 1000/2000 P1-标准
3.75小时
2.5
N/A
40 分钟
可选择性清除试剂：
1.5小时**
NextSeq 1000/2000 P2-标准
4小时
4.7
N/A
40 分钟
可选择性清除试剂：
1.5小时**
NextSeq 1000/2000 P3-标准
4小时
8.4
N/A
45 分钟
可选择性清除试剂：
3小时**
NextSeq 1000/2000 P1-XLEAP
4小时
1.7
N/A
74 分钟
可选择性清除试剂：1.3-3.2小时**
NextSeq 1000/2000 P2- XLEAP
4小时
3.4
N/A
74 分钟
可选择性清除试剂：
1-3.2小时**
NextSeq 1000/2000 P3- XLEAP
5小时
6.4
N/A
80 分钟
可选择性清除试剂：1.4-2.7小时**
NextSeq 1000/2000 P4- XLEAP
5小时
7.4
N/A
80 分钟
可选择性清除试剂：1.4-2.7小时**
NovaSeq 6000
180分钟¤
SP/S1 = 3.5 S2 = 5 S4 = 6.75
N/A
48 分钟
运行后清洗=80 分钟
维护清洗=80分钟
NovaSeq X系列
1.5B = 5小时 10B = 4.8小时 25B = 5.8小时
1.5B = 2.2分钟 10B = 2.7分钟 25B = 6.1分钟
N/A
1.5B = 67分钟 10B = 48分钟 25B = 84分钟
运行后清洗=110 分钟(1.5B流动槽清洗耗时180 分钟)
维护清洗=180分钟(1.5B流动槽不可用于维护清洗)
预计运行时间将取决于簇密度和可用的计算机资源。如果硬盘没有足够的空间进行数据处理，或者网络定位速度很慢，运行时间可能会延长。Illumina平台最大读数长度的总运行时间，以及其他测序运行规格，可以在 Illumina Sequencing Platforms 上找到。
For any feedback or questions regarding this article (Illumina Knowledge Article #7137), contact Illumina Technical Support [email protected].
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