Illumina测序平台上每个测序步骤的运行时间预测
Illumina测序的运行时间包括簇生成、边合成边测序化学循环、双端化学反应和清洗步骤。此外，使用非Pattern模式的flow cell的运行在构建模板时会暂停一段时间。为了帮助规划测序工作流程和预测整体运行时间 ，表1根据Illumina测序平台和试剂版本总结了每个测序步骤的预估时长。
仪器 | cBot上 簇生成 | 测序仪器上簇生成 | 每个循环的时间（分钟） | 模板构建暂停时间** | 双端测序反转时间 | 快速清洗/手动或者维护清洗（分钟） |
iSeq 100 | N/A | 5小时 | 2.2 | N/A | 52 分钟 | 无需清洗 |
MiniSeq | N/A | 90分钟 | 3.5 | 测序继续 | 60 分钟 | 20 / 75 |
MiSeq v2 | N/A | 60分钟 | 4.5
(Micro = 3 Nano = 2.5) | 测序继续 | 31 分钟 | 运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟 |
MiSeq v3 | N/A | 70分钟 | 6 | 测序继续 | 50 分钟 | 运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟 |
NextSeq 500/550 | N/A | 2.5小时 | 4.6 | 测序继续 | 60 分钟 | 20 / 90 |
NextSeq 1000/2000 | N/A | 4小时 | 5 | N/A | 45 分钟 | 可选择性清除试剂：3小时 |
HiSeq 2500
RRv2 OBCG* | N/A | 1.5小时 | 7 | 1.5 - 2 小时 | 1 小时 | 15 / 60 |
HiSeq 2500
RRv2 w/ cBot | 1 小时
(只传递模板，没有进行桥式扩增) | 1.5小时 | 7 | 1.5 - 2 小时 | 1 小时 | 15 / 60 |
HiSeq 2500
TruSeq v3 | < 5 小时 | N/A | 53
67 （如果同时运行两张芯片） | 4 - 8 小时 | 4.5 小时 | 20（清洗限于位置1-8）或者
60 / 130 |
HiSeq 2500
HiSeq v4 | 2 小时 | N/A | 19
30 （如果同时运行两张芯片） | 5 - 6 小时 | 3 小时 | 20（清洗限于位置1-8）或者
60 / 130 |
HiSeq
3000/4000 | 双端3小时 单端4小时 | N/A | 12#
16# （如果同时运行两张芯片） | N/A | 2.5 小时 | 20（清洗限于位置1-8）或者
60 / 130 |
HiSeq X v2.5 | 3小时 | N/A | 12# | N/A | 2.5 小时 | 20（清洗限于位置1-8）或者
60 / 130 |
NovaSeq | N/A | 130¤分钟 | SP/S1 = 3.5
S2 = 5
S4 = 6.75 | N/A | 48 分钟 | 80 |
表1：每台仪器和该仪器支持试剂的每个测序步骤的大致时间
* OBCG = 测序仪器上进行簇生成
** 模板构建时间会根据簇密度而变化
¤ XP工作流程大约115分钟，因为ExAmp步骤被跳过了
# 在这些运行中第2-5个循环可能需要大约25分钟/每个循环
预计运行时间将取决于簇密度和可用的计算机资源。如果硬盘没有足够的空间进行数据处理，或者网络定位速度很慢，运行时间可能会延长。Illumina平台最大读数长度的总运行时间，以及其他测序运行规格，可以在 Illumina Sequencing Platforms 上找到。
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