# Illumina测序平台上每个测序步骤的运行时间预测
Illumina测序的运行时间包括簇生成、边合成边测序化学循环、双端化学反应和清洗步骤。此外，使用非Pattern模式的flow cell的运行在构建模板时会暂停一段时间。为了帮助规划测序工作流程和预测整体运行时间，表1根据Illumina测序平台和试剂版本总结了每个测序步骤的预估时长。
| 仪器 | 测序仪器上簇生成 | 每个循环的时间(分钟) | 模板构建暂停时间\* | 双端测序反转时间 | 运行后清洗/维护清洗 |
| --------------------------- | ---------------------------------------------------------------------- | -------------------------------------------------- | ---------- | ---------------------------------------------- | ------------------------------------------------------------------------ |
| iSeq 100 | 5小时 | 2.2 | N/A | 52 分钟 | 无需清洗 |
| MiniSeq | 90分钟 | 3.5 | 运行继续 | 60 分钟 | 75分钟 |
| MiniSeq
(快速运行)
| 整体运行时间：
单index, 1x 101 -5.1小时
双index, 1x 101 -5.7小时
| N/A | 运行继续 | N/A | N/A |
| MiSeq v2 | 60分钟 | Nano = 2.5
Micro = 3
Full = 4.5
| 运行继续 | 31 分钟 | 运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟 |
| MiSeq v3 | 70分钟 | 6 | 运行继续 | 50 分钟 | 运行后清洗20分钟，模板管路清洗30分钟，维护清洗90分钟 |
| MiSeq i100系列 | \~ 120分钟 | \~ 1分钟 | N/A | \~ 60 分钟 | N/A |
| NextSeq 500/550 (中通和高通试剂) | 2.5小时 | 4.6 | 运行继续 | 60 分钟 | 90分钟 |
| NextSeq 1000/2000 P1-标准 | 3.75小时 | 2.5 | N/A | 40 分钟 | 可选择性清除试剂：
1.5小时\*\*
|
| NextSeq 1000/2000 P2-标准 | 4小时 | 4.7 | N/A | 40 分钟 | 可选择性清除试剂：
1.5小时\*\*
|
| NextSeq 1000/2000 P3-标准 | 4小时 | 8.4 | N/A | 45 分钟 | 可选择性清除试剂：
3小时\*\*
|
| NextSeq 1000/2000 P1-XLEAP | 4小时 | 1.7 | N/A | 74 分钟 | 可选择性清除试剂：1.3-3.2小时\*\* |
| NextSeq 1000/2000 P2- XLEAP | 4小时 | 3.4 | N/A | 74 分钟 | 可选择性清除试剂：
1-3.2小时\*\*
|
| NextSeq 1000/2000 P3- XLEAP | 5小时 | 6.4 | N/A | 80 分钟 | 可选择性清除试剂：1.4-2.7小时\*\* |
| NextSeq 1000/2000 P4- XLEAP | 5小时 | 7.4 | N/A | 80 分钟 | 可选择性清除试剂：1.4-2.7小时\*\* |
| NovaSeq 6000 | 180分钟¤ | SP/S1 = 3.5
S2 = 5
S4 = 6.75
| N/A | 48 分钟 | 运行后清洗=80 分钟
维护清洗=80分钟
|
| NovaSeq X系列 | 1.5B = 5小时
10B = 4.8小时
25B = 5.8小时
| 1.5B = 2.2分钟
10B = 2.7分钟
25B = 6.1分钟
| N/A | 1.5B = 67分钟
10B = 48分钟
25B = 84分钟
| 运行后清洗=110 分钟(1.5B流动槽清洗耗时180 分钟)
维护清洗=180分钟(1.5B流动槽不可用于维护清洗)
|
```
表1：每台测序仪和该仪器支持试剂的每个测序步骤的大致时间
* 模板构建时间会根据簇密度而变化
¤ XP的工作流程大约是150分钟，因为省略了ExAmp的步骤
# 在这些运行中第2-5个循环可能需要大约25分钟/每个循环
** 清除试剂的时间根据循环次数而变化
```
### 预计运行时间将取决于簇密度和可用的计算机资源。如果硬盘没有足够的空间进行数据处理，或者网络定位速度很慢，运行时间可能会延长。Illumina平台最大读数长度的总运行时间，以及其他测序运行规格，可以在 [Illumina Sequencing Platforms](https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms.html) 上找到。
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