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如何在HiSeq 2500和MiSeq系统上重启RTA
RTA（Real-Time Analysis）是一个集成软件，它能够对测序过程中产生的簇影像进行分析并计算各项参数。当RTA停滞不前或者网络路径宕机时，您可能需要手动终止并重启RTA。
需要注意的是HiSeq 3000/4000, HiSeq X, MiniSeq, NextSeq500/550, iSeq 100和NovaSeq 6000测序平台使用的RTA版本不同，在这些测序平台上，RTA无法进行重启。
在MiSeq上重启RTA:
- 1.确认RTA确实没有完成分析。在测序文件夹(D:\Illumina\MiSeq Temp\<run folder>)中确认RTAComplete.txt文件不存在。
- 2.在任务管理器中终止RTA。点击Windows的启动按钮（位于电脑屏幕的左下方），搜索任务管理器。也可以同时按下键盘的Ctrl+Alt+Delete键，启动任务管理器。
- 3.在任务管理器中，点击Processes标签，在该页面下找到RTA.exe，右键选择End Process结束进程。
- 4.在D:\Illumina\MiSeq Temp\<run folder>\Config文件夹中双击RTAstart.bat，重启RTA。
- 5.确保RTA.exe出现在任务管理器Processes中。注意: 此时会弹出一个小的命令运行窗口，它表明RTA正在进行，你可以将这个窗口最小化。
在HiSeq 2500上重启RTA:
注意，D盘路径针对的是Flow Cell A，E盘路径针对的是Flow Cell B。
- 1.确认RTA确实没有完成分析。在测序文件夹(D:\Illumina\HiSeq Temp\<run folder>)或(E:\Illumina\HiSeq Temp\<run folder>)中确认RTAComplete.txt文件不存在。
- 2.为了终止当前RTA 程序，找到大的RTA窗口，它包含当前测序实验的Tile分析进度和Log Output标签。选择Log Output标签
- 3.在Log Output标签页面下，为所有的暂停复选框打勾，可能是4个或者8个（一个勾选标记表示暂停一个任务），然后选择Terminate RTA。
- 4.选择YES确认终止RTA。
- 5.在D:\Illumina\HiSeq Temp\<run folder>\Config或E:\Illumina\HiSeq Temp\<run folder>\Config文件夹中双击RTAstart.bat，重启RTA。
- 6.此时会弹出两个窗口，表示RTA已经被重启。这两个窗口都可以被最小化。
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