Illumina测序系统废液中甲酰胺的终浓度是多少?
该技术文档提供的信息,能够帮助您计算Illumina测序反应废液中甲酰胺的终浓度。
每个测序反应废液中甲酰胺的浓度会基于测序平台和测序长度而有所差异。您可以根据下表的说明,测量废液的总体积,并计算甲酰胺的终浓度。
测序平台 | 试剂版本 | 甲酰胺试剂名称 | 位置 | 甲酰胺试剂填充体积(mL) | 废液中甲酰胺浓度计算 |
iSeq 100* | i1 | Unlabeled | N/A | 2.00 | 2.0 mL/144.5 mL = 1.4% |
MiniSeq | v1 | Denature Reagent | 9 | 5.47 | (甲酰胺试剂)/ (总的废液体积) = % *如果将剩余的甲酰胺手动倒入或者自动排入废液中,使用填充体积. |
MiSeq | v2 | LDR | 8 | 2.48 | |
v3 | LDR | 8 | 2.48 | ||
NextSeq 500/550 | v2.5 - Mid Output | Denature Reagent | 6 | 16.89 | |
v2.5 - High Output | Denature Reagent | 6 | 27.09 | ||
HiSeq 1000/1500/ 2000/2500 | High Output - v3 | AT2 | 15 | 5.50 | |
High Output - v4 | FDR | 15 | 7.05 | ||
Rapid v2 | FDR | 15 | 5.04 | ||
HiSeq 3000/4000 | v1 | HDR | 15 | 10.56 | |
HiSeq X | v2 | PDR | 15 | 10.56 | 10.56 mL/1.3 L = 0.8% |
NextSeq 1000/2000 | P2 | Unlabeled | N/A | 1.74 | 剩余的甲酰胺排入废液中 1.74mL/170mL = 1.02%** |
P3 | Unlabeled | N/A | 1.74 | 剩余的甲酰胺排入废液中 1.74mL/187.8mL = 0.93%** | |
NovaSeq | SP, S1, & S2 | Denature Reagent | 30 | 9.00 | 10% |
S4 | Denature Reagent | 30 | 22.00 | 10% |
*由于iSeq100试剂槽不能打开,因此它是以固体废弃物处理。
**如果剩余甲酰胺没有排入废液中,基于不同测序长度甲酰胺的浓度范围为0.8-1.5%
例如:HiSeq X v2测序会排放约10.56ml甲酰胺试剂到废液槽中。总的废液体积约为1.3L。因此废液中甲酰胺的终浓度约为0.8%。
请穿戴合适的个人保护装备安全处理甲酰胺试剂。在不同地区,根据废液中甲酰胺和其它有害成分,对废液的处理也有所差异。请联系当地的环境卫生和安全(EH&S)办公室,确定对有害物质的界定以及如何处理容器和未使用的有害物质,以符合环境安全。如果需要Illumina试剂中化学成分的更多信息,请参考Illumina支持页面中的安全数据表(SDS。
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