测序前准备和检查NovaSeq 6000 流动槽的最佳操作

测序前对NovaSeq 6000 的流动槽(Flow Cell)进行适当的准备和检查可以减少与真空相关问题的发生,并且可以减少仪器漏气。本技术公告介绍了如何准备和检查NovaSeq 6000 流动槽以保证测序成功。

准备和检查NovaSeq 流动槽的最佳操作

  1. 从2℃到8℃储存条件下移除流动槽包装纸盒。

  2. 将密封的流动槽包装放置10-15 min,以使得流动槽达到室温。打开包装后需要在12 h内使用流动槽。

  3. 检查流动槽的上下表面,以核实是否有任何损坏,例如裂缝或碎屑。

    1. 如果在流动槽的下表面有碎屑或任一表面有裂缝,请联系 Illumina技术支持 评估流动槽。

  4. 检查流通槽垫圈内(Gaskets)或附近是否有任何颗粒材料(详见图1。

    1. 如果观察到颗粒,轻轻擦去碎屑或翻转流动槽,然后轻轻敲击桌子上的流动槽以去除颗粒;

    2. 如果无法清除阻塞垫圈的颗粒,请联系 Illumina技术支持 讨论是否继续使用这个流动槽。

图1. 阻塞流动槽垫圈的颗粒材料示例

  1. 芯片使用前建议客户对外观进行检查,若看到如下描述的表现,实际并不影响产量或质量,并且性能良好。常见的外观瑕疵主要包括流动槽的可变彩虹色、流动槽中的圆形斑点、流动槽表面或内部的划痕或流动槽表面的碎屑(详见图2)流动槽需经过严格的视觉质量控制(QC),请检查流动槽是否存在其余异常的外观缺陷。

  1. 在NovaSeq 6000上加载流动槽之前,检查流动槽和NovaSeq 6000 流动槽载物台是否有玻璃碎片或任何碎屑。

    <ol start="1" style="list-style-type: lower-alpha;"><li><span style="font-size: 14px;"><span style="font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">玻璃碎屑可影响成功测序所需的真空密封。想了解更多详细信息,请参阅 <a href="https://www.youtube.com/watch?app=desktop&amp;v=w0QLmN2JSDk" target="_blank">NovaSeq 6000流动槽加载故障排除</a> 视频。</span></span></li><li><span style="font-size: 14px;"><span style="font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">检查流动槽底部是否有玻璃碎片。如果存在玻璃碎片,请用酒精擦拭流动槽的底部。然后用干净、干燥的无尘纸擦干流动槽。</span></span></li><li><span style="font-size: 14px;"><span style="font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">检查NovaSeq 6000的流动槽载物台,包括凹槽、真空管和集合管(Manifolds)</span></span>
    	<ol start="1" style="list-style-type: lower-roman;"><li><span style="font-size: 14px;"><span style="font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">如果流动槽载物台没有碎屑或玻璃碎片,请使用酒精擦拭物清洁流动槽加载位置、集合管(Manifolds)和流动槽夹。用干净、干燥的无尘纸擦去残留的酒精。</span></span></li><li><span style="font-size: 14px;"><span style="font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">如果观察到碎屑或玻璃碎片(见图3),请用酒精擦拭物吸干流动槽载物台以去除碎屑。吸干后,目视检查流动槽载物台确认碎屑已去除。用干净、干燥的无尘纸去除任何残留的酒精。</span></span></li></ol>
    	</li></ol>
    </li></ol>

    图3. 在 NovaSeq 6000 流通槽载物台上观察到的玻璃碎片示例

    1. 如有与本技术公告中概述的信息有关的任何问题或疑虑,请联系 Illumina技术支持 。技术支持可以评估是否继续使用流动槽。提供流通槽图片和批次信息可以帮助Illumina提供适当的指导。

    资源:

    For any feedback or questions regarding this article (Illumina Knowledge Article #7097), contact Illumina Technical Support techsupport@illumina.com.

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