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PhiX Control v3文库是什么,它在Illumina下一代测序中起到什么作用?

PhiX Control v3文库(通常指PhiX,货号是FC-110-3001)来源于小型,特征明确的噬菌体PhiX基因组。它是一个平均片段长度为500bp并且由平衡碱基组成(GC碱基占比约45% ,AT碱基占比约55%)的浓缩型Illumina文库 (体积10µl,浓度10nM)。
1. 校准质控
PhiX Control v3文库可以单独测序以作为以下项目的校准质控:
  • 串扰矩阵的生成 (Cross talk matrix generation)
  • Phasing和prephasing的计算
  • Illumina测序平台整体性能的检测
更详细的信息请参考如下链接:
2. 监测测序质量
由于PhiX Control v3文库小且核苷酸组成平衡,因此它也可作为监测测序实验运行质量(例如簇生成效果,测序运行进展和序列比对占比)的理想内对照(通常掺入≥1%)。
3. 均衡荧光信号
对于低多样性的文库,PhiX Control v3文库在每个循环提供均衡的荧光信号,以提高整体测序质量。有关详细信息,请参阅:
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