PhiX Control v3文库是什么，它在Illumina下一代测序中起到什么作用？

PhiX Control v3文库（通常指PhiX，货号是FC-110-3001）来源于小型，特征明确的噬菌体PhiX基因组。它是一个平均片段长度为500bp并且由平衡碱基组成（GC碱基占比约45% ，AT碱基占比约55%）的浓缩型Illumina文库 （体积10µl，浓度10nM）。

1. 校准质控

PhiX Control v3文库可以单独测序以作为以下项目的校准质控：

• 串扰矩阵的生成 （Cross talk matrix generation）

• Phasing和prephasing的计算

• Illumina测序平台整体性能的检测

更详细的信息请参考如下链接：

• PhiX loading concentrations for validation runs on Illumina sequencing platforms

• How to set up the sample sheet for a PhiX validation run on the MiSeq system using Illumina Experiment Manager

• How to set up a PhiX validation run on the NextSeq 500/550 in manual mode

• How to set up a PhiX validation run on the NextSeq 500/550 system using BaseSpace Hub Prep tab

• How to set up a PhiX validation run on the NextSeq 1000/2000 sequencing platform

• How to set up a PhiX validation run on the NovaSeq 6000 sequencing platform

• Local Run Manager: How to set up a PhiX validation run

2. 监测测序质量

由于PhiX Control v3文库小且核苷酸组成平衡，因此它也可作为监测测序实验运行质量（例如簇生成效果，测序运行进展和序列比对占比）的理想内对照（通常掺入≥1％）。

3. 均衡荧光信号

对于低多样性的文库，PhiX Control v3文库在每个循环提供均衡的荧光信号，以提高整体测序质量。有关详细信息，请参阅：

什么是核苷酸多样性，它为什么十分重要？

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