Illumina 测序平台的最大读长

Illumina平台和测序试剂盒支持多种 测序应用 。 为了保证最高水平的测序质量，Illumina不同测序平台以及不同的SBS试剂盒版本支持的最大读长有所不同，相关信息请参阅 我所购买的SBS试剂盒最多能够满足多少个循环的测序？ 技术文档。利用本地运行管理软件（ Local Run Manager，LRM）或仪器控制软件（Control Software）设置测序运行时，可以选择更长的读长。但是当read长度超过支持的长度时，Illumina将无法保证较高的数据质量。

表 1. 测序平台和SBS试剂盒支持的最大读长

* MO: 中通量 / HO: 高通量

** 快速试剂盒

Index Reads的最大读长

• 仪器控制软件：如表2所示，可在某些仪器的运行设置期间输入自定义Index读长：

• LRM v2：Index读长最多可以设置100个字符（请参阅：Local run Manager 2: 如何使用自定义文库制备试剂盒技术文档）。

• LRM v3：最多输入20个字符。如果需要20-100 bp读长，请选择手动上机模式。

• 为确保Index Reads的测序质量，请勿超过Index支持的最大长度。

• 设置运行时，测序的总读长不能超过所用试剂盒最大支持读长。

表 2. 测序平台的最大单个Index长度

*通过云端设置测序运行时，index长度最长为12bp **index长度为20-100bp之间时，通过手动模式设置测序运行，因为LRM V3的上限为20bp ***手动设置测序运行不在测序仪进行分析的话，index长度不受软件限制

请注意，BCL Convert对index长度是有限制的。BCL Convert 4.2以及之前版本，index总长度不能超过27bp。 BCL Convert 4.3以及之后版本，index长度限制提高到每个index最长27bp。

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