Illumina 测序平台的最大读长
Illumina平台和测序试剂盒支持多种 测序应用. 为了保证最高水平的测序质量，Illumina根据测序平台和SBS试剂盒版本支持最长特定的读长，请参阅“ 我所购买的SBS试剂盒最多能够满足多少个循环的测序？ 技术文档。在本地运行管理软件（ Local Run Manager，LRM）或仪器控制软件（Control Software）运行设置期间，可以选择更长的读长。但是当read长度超过支持的长度，Illumina将无法保证较高的数据质量。
表 1. 测序平台和SBS试剂盒支持的最大读长
测序平台 | SBS 试剂盒版本 | 最大读长 |
iSeq 100 | v1 | 2 x 151bp |
v2 | 2 x 151bp | |
MiniSeq | MO* | 2 x 151bp |
HO* | 2 x 151bp | |
MiSeq | v2 | 2 x 251bp |
v3 | 2 x 301bp | |
NextSeq 500/550 | MO* | 2 x 151bp |
HO* | 2 x 151bp | |
NextSeq 1000/2000 | P1, P2, P3 | 2 x 151bp |
HiSeq 1000/1500/2000/2500 | HO* v3 | 2 x 101bp |
HO* v4 | 2 x 126bp | |
RR** v4 | 2 x 251bp | |
HiSeq 3000/4000 | N/A | 2 x 151bp |
HiSeq X | N/A | 2 x 151bp |
NovaSeq 6000 | SP | 2 x 251bp |
S1, S2, S4 | 2 x 151bp | |
* MO: 中通量 / HO: 高通量
** 快速试剂盒
Index Reads的最大读长
- 仪器控制软件：如下表2所示，可在某些仪器的运行设置期间输入自定义Index读长：
- LRM v3：最多输入20个字符。如果需要20-100 bp读长，请选择手动上机模式。
- 为确保Index Reads的测序质量，请勿超过Index支持的Reads长度。
表 2. 测序平台的最大单个Index长度
测序平台 | 单端或双端Index(最大读长) |
iSeq 100 | 软件不限制 |
MiniSeq v1.X | 20 bp |
MiniSeq v2.X | 20 bp |
MiSeq < v4 | 软件不限制 |
MiSeq ≥ v4 | 100 bp** |
NextSeq 500/550 v2 NCS | 20 bp |
NextSeq 500/550 v4 NCS | 20 bp |
NextSeq 1000/2000* | 软件不限制 |
HiSeq 2500 | 软件不限制 |
HiSeq 3000/4000 | 软件不限制 |
HiSeq X | 单端Index为 6 bp / 双端Index为 2 x 8 bp |
NovaSeq 6000 < v1.6.0 | 20 bp |
NovaSeq 6000 ≥ v1.6.0 | 软件不限制 |
*在云模式下设置运行时，Index长度限制在10 bp以内。
**对于20-100 bp之间的Index读长，请使用手动上机模式，因为LRM v3的Index读长限制在20 bp以内。
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