如何在Local Run Manage中进行重分析（Requeue）及导入运行数据（Import）再分析

Local Run Manager软件是一个集成的解决方案，它不仅可以用于记录测序运行的样本、测序反应的参数、还能监控测序运行状态和执行数据分析，同时还可以查看测序结果。

重要提示：本公告中的说明适用于Local Run Manager v4.X及更低的版本 。

本公告描述了如何在Local run Manager中使用相同模块来进行重新分析，同时也描述了如何通过导入数据来使用其他模块进行重新分析。

使用相同的模块进行重新分析：

1. 从“Local run Manager”的仪表板（dashboard）中，找到你想重新分析的测序运行，点击这个测序运行旁边的Actions选项，选择Requeue。

2. 在弹出的窗口中，选择是Edit Setup还是直接使用原来设置好的信息进行Requeue。

3. 如果选择了Edit Setup，就请更改所需要的参数，然后选择Requeue Analysis。重新分析完成后，状态栏将会显示 为Analysis Completed。

通过导入数据来使用其他模块进行重新分析：

注意: 通过导入数据的方式，可以使用其他模块来重新分析现有的测序结果，这个操作也可以脱机在测序仪以外的电脑进行。

1. 从仪表板（dashboard）中，选择创建测序运行Create Run并选择所需的模块。然后设置测序的相关参数，然后选择Save run。这个测序运行的参数必须与原来测序运行的参数相同，其中重要的信息包括read的测序类型（单端/双端）、read的测序循环数、index的个数和读长，同时也要注意是否使用了定制的测序引物（custom primer）。原始run的相关参数和设置可以通过不同的方式确定:

   1. 对于之前已经在Local Run Manager中分析过的测序运行，我们可以在仪表板（dashboard）点击这个Run，接着点击 Requeue Analysis - Edit Setup 查看这次运行的参数和设置。

   2. 当使用Local Run Manager 2进行重新分析时，我们可以通过直接点击Import Sample Sheet这一选项来自动读取这次运行的相关参数和设置。

   3. 对于测序时所读取的cycle数也可以在output文件夹中的RunInfo.xml文件里找到。

   4. 有关不同模块特定参数的设置，请参阅analysis module workflow guides。

1. 在仪表板（dashboard）中，找到刚刚创建的运行。

2. 在新创建的运行旁边点击Actions并选择Import。

1. 输入完整的文件夹路径（需要重新分析的运行的文件夹路径）和输出文件夹位置。确保输出文件夹的位置与输入运行的文件夹的路径不同。

注意: Local Run Manager不支持映射的驱动器或路径，但支持UNC路径。同时Local Run Manager可能无法从一些特定的位置(如桌面或文档)导入运行。建议从较常规的位置（如D:\）导入运行数据。从网络位置导入的运行可能比从本地位置导入的运行需要更长的分析时间。

1. 选择Import Run开始分析。重新分析完成后，状态栏将会显示为Analysis Completed。

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