测序运行输出文件夹的近似大小

重要说明：本公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹（Output folder）大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽（Flow Cell）的测序运行，输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。

其他文件大小估算的注意事项

• iSeq 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。

• MiniSeq和NextSeq 500/550（NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本）文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。

• MiSeq 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。

• NextSeq 1000/2000文件夹大小包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同，可能额外增加25-120+GB数据量。

• NovaSeq 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。

Illumina推荐将 iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq 6000 和 NovaSeq X 系列的控制软件要求把Output文件夹存储在网络位置。

iSeq 100

测序读长	文件夹大小（GB）
2 x 150 bp	1.5 - 2.5

MiniSeq

测序读长	中通量Output文件夹大小（GB）	高通量Output文件夹大小（GB）	快速试剂盒Output文件夹大小（GB）
2 x 150 bp	2.3 - 2.6	7.0 - 8.0	N/A
2 x 75 bp	N/A	6.0 - 8.0	N/A
1 x 100 bp	N/A	N/A	2
1 x 75 bp	N/A	2.0 - 4.0	N/A

MiSeq

v3 Chemistry

测序读长	Output文件夹大小（GB）
2 x 300 bp	22 - 26
2 x 75 bp	19 - 22

v2 Chemistry

测序读长	测序试剂盒配置	Output文件夹大小（GB）
2 x 250 bp	Standard	22 - 24
2 x 250 bp	Nano	1.6 - 1.8
2 x 150 bp	Standard	16 - 18
2 x 150 bp	Micro	3.0 - 5.0
2 x 150 bp	Nano	0.8 - 1.2
2 x 25 bp	Standard	14 - 16

MiSeq i100 系列

请见知识文章 Estimating Disk Space Utilization on the MiSeq i100 Series

NextSeq 500/550

测序读长	中通量Output文件夹大小（GB）	高通量Output文件夹大小（GB）
2 x 150 bp	62 - 66	160 - 170
2 x 75 bp	39 - 46	92 - 97
1 x 75 bp	N/A	50 - 78

NextSeq 1000/2000 (Standard 和 XLEAP 运行预计产出的文件夹大小相似）

测序读长	P1 Output文件夹大小（GB）	P2 Output文件夹大小（GB）	P3 Output文件夹大小（GB）	P4(XLEAP试剂)Output文件夹大小（GB）
2 x 300 bp	85 - 95	140 - 160	N/A	N/A
2 x 150 bp	50 - 55	89 - 99	165 - 170	170-180
2 x 101 bp	40 - 45	65 - 66	103 - 126	100-130
2 x 75 bp	35 - 40	44 - 55	N/A	N/A
2 x 50 bp	N/A	N/A	N/A	70-80
1 x 50 bp	N/A	N/A	N/A	40-50

NovaSeq 6000

测序读长	SP 流动槽Output文件夹大小（GB）	S1 流动槽Output文件夹大小（GB）	S2 流动槽Output文件夹大小（GB）	S4 流动槽Output文件夹大小（GB）
1 x 36 bp	20	N/A	N/A	240
2 x 150 bp	185	370	730	2190
2 x 250 bp	400	N/A	N/A	N/A

这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes, GB)为单位。

NovaSeq X/X Plus

下表中的数据为单张Flow cell输出的文件夹大小，以太字节(Terabytes, TB)为单位

1.5B Flow cell

测序读长	cBCL Only in TB	BCL Convert (GZIP) in TB	BCL Convert (ORA) in TB
2 x 50 bp	0.054 - 0.091	0.132 - 0.221	0.086 - 0.143
2 x 100 bp	0.106 - 0.181	0.265 - 0.442	0.173 - 0.286
2 x 150 bp	0.163 - 0.272	0.397- 0.662	0.259 - 0.429

10B Flow cell

测序读长	cBCL Only in TB	BCL Convert (GZIP) in TB	BCL Convert (ORA) in TB
2 x 50 bp	0.34 - 0.57	0.83 - 1.38	0.54 - 0.89
2 x 100 bp	0.68 - 1.13	1.65 - 2.76	1.08 - 1.79
2 x 150 bp	1.02 - 1.70	2.48 - 4.14	1.62 - 2.68

25B Flow cell

测序读长	cBCL Only in TB	BCL Convert (GZIP) in TB	BCL Convert (ORA) in TB
2 x 50 bp	0.85 - 1.42	2.07 - 3.45	1.35 - 2.23
2 x 100 bp	1.70 - 2.83	4.13 - 6.90	2.70 - 4.47
2 x 150 bp	2.55 - 4.25	6.200 - 10.35	4.05 - 6.70

DRAGEN分析文件可能根据所选分析选项，在预期输出文件夹大小基础上额外增加以下数据（单位：太字节TB）。文件大小估算基于单个flow cell、2×150循环测序运行。

Flow cell类型	BAM (TB)	CRAM (TB)	GVCF+VCF (TB)
1.5B	0.4	0.1	<0.1
10B	2.5	1.0	0.2
25B	6.3	2.5	0.5

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