# 测序运行输出文件夹的近似大小

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**重要说明：**&#x672C;公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹（Output folder）大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽（Flow Cell）的测序运行，输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。\
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**其他文件大小估算的注意事项**

* iSeq 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。
* MiniSeq和NextSeq 500/550（NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本）文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。
* MiSeq 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件。
* NextSeq 1000/2000文件夹大小包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同，可能额外增加25-120+GB数据量。
* NovaSeq 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。

Illumina推荐将 iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq 6000 和 NovaSeq X 系列的控制软件要求把Output文件夹存储在网络位置。

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**iSeq 100**

| 测序读长       | 文件夹大小（GB） |
| ---------- | --------- |
| 2 x 150 bp | 1.5 - 2.5 |

&#x20;

**MiniSeq**

| 测序读长       | 中通量Output文件夹大小（GB） | 高通量Output文件夹大小（GB） | 快速试剂盒Output文件夹大小（GB） |
| ---------- | :----------------: | :----------------: | :------------------: |
| 2 x 150 bp |      2.3 - 2.6     |      7.0 - 8.0     |          N/A         |
| 2 x 75 bp  |         N/A        |      6.0 - 8.0     |          N/A         |
| 1 x 100 bp |         N/A        |         N/A        |           2          |
| 1 x 75 bp  |         N/A        |      2.0 - 4.0     |          N/A         |

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**MiSeq**

v3 Chemistry

|    测序读长    | Output文件夹大小（GB） |
| :--------: | :-------------: |
| 2 x 300 bp |     22 - 26     |
|  2 x 75 bp |     19 - 22     |

v2 Chemistry

|    测序读长    |  测序试剂盒配置 | Output文件夹大小（GB） |
| :--------: | :------: | :-------------: |
| 2 x 250 bp | Standard |     22 - 24     |
| 2 x 250 bp |   Nano   |    1.6 - 1.8    |
| 2 x 150 bp | Standard |     16 - 18     |
| 2 x 150 bp |   Micro  |    3.0 - 5.0    |
| 2 x 150 bp |   Nano   |    0.8 - 1.2    |
|  2 x 25 bp | Standard |     14 - 16     |

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**MiSeq i100 系列**

请见知识文章 [Estimating Disk Space Utilization on the MiSeq i100 Series](https://knowledge.illumina.com/instrumentation/miseq-i100-series/instrumentation-miseq-i100-series-reference_material-list/000009356)

&#x20;

**NextSeq 500/550**

| 测序读长       | 中通量Output文件夹大小（GB） | 高通量Output文件夹大小（GB） |
| ---------- | :----------------: | :----------------: |
| 2 x 150 bp |       62 - 66      |      160 - 170     |
| 2 x 75 bp  |       39 - 46      |       92 - 97      |
| 1 x 75 bp  |         N/A        |       50 - 78      |

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**NextSeq 1000/2000 (Standard 和 XLEAP 运行预计产出的文件夹大小相似）**

| 测序读长       | P1 Output文件夹大小（GB） | P2 Output文件夹大小（GB） | P3 Output文件夹大小（GB） | P4(XLEAP试剂)Output文件夹大小（GB） |
| ---------- | :----------------: | :----------------: | :----------------: | -------------------------- |
| 2 x 300 bp |       85 - 95      |      140 - 160     |         N/A        | N/A                        |
| 2 x 150 bp |       50 - 55      |       89 - 99      |      165 - 170     | 170-180                    |
| 2 x 101 bp |       40 - 45      |       65 - 66      |      103 - 126     | 100-130                    |
| 2 x 75 bp  |       35 - 40      |       44 - 55      |         N/A        | N/A                        |
| 2 x 50 bp  |         N/A        |         N/A        |         N/A        | 70-80                      |
| 1 x 50 bp  |         N/A        |         N/A        |         N/A        | 40-50                      |

&#x20;

**NovaSeq 6000**

| 测序读长       | <p>SP 流动槽Output文件夹大小（GB）<br></p> | <p>S1 流动槽Output文件夹大小（GB）<br></p> | <p>S2 流动槽Output文件夹大小（GB）<br></p> | <p>S4 流动槽Output文件夹大小（GB）<br></p> |
| ---------- | -------------------------------- | -------------------------------- | -------------------------------- | -------------------------------- |
| 1 x 36 bp  | 20                               | N/A                              | N/A                              | 240                              |
| 2 x 150 bp | 185                              | 370                              | 730                              | 2190                             |
| 2 x 250 bp | 400                              | N/A                              | N/A                              | N/A                              |

这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes, GB)为单位。

&#x20;

**NovaSeq X/X Plus**

下表中的数据为单张Flow cell输出的文件夹大小，以太字节(Terabytes, TB)为单位

1.5B Flow cell

| 测序读长       | **cBCL Only in TB** | BCL Convert (GZIP) in TB | BCL Convert (ORA) in TB |
| ---------- | ------------------- | ------------------------ | ----------------------- |
| 2 x 50 bp  | 0.054 - 0.091       | 0.132 - 0.221            | 0.086 - 0.143           |
| 2 x 100 bp | 0.106 - 0.181       | 0.265 - 0.442            | 0.173 - 0.286           |
| 2 x 150 bp | 0.163 - 0.272       | 0.397- 0.662             | 0.259 - 0.429           |

&#x20;

10B Flow cell

| 测序读长       | **cBCL Only in TB** | BCL Convert (GZIP) in TB | BCL Convert (ORA) in TB |
| ---------- | ------------------- | ------------------------ | ----------------------- |
| 2 x 50 bp  | 0.34 - 0.57         | 0.83 - 1.38              | 0.54 - 0.89             |
| 2 x 100 bp | 0.68 - 1.13         | 1.65 - 2.76              | 1.08 - 1.79             |
| 2 x 150 bp | 1.02 - 1.70         | 2.48 - 4.14              | 1.62 - 2.68             |

&#x20;

25B Flow cell

| 测序读长       | **cBCL Only in TB** | BCL Convert (GZIP) in TB | BCL Convert (ORA) in TB |
| ---------- | ------------------- | ------------------------ | ----------------------- |
| 2 x 50 bp  | 0.85 - 1.42         | 2.07 - 3.45              | 1.35 - 2.23             |
| 2 x 100 bp | 1.70 - 2.83         | 4.13 - 6.90              | 2.70 - 4.47             |
| 2 x 150 bp | 2.55 - 4.25         | 6.200 - 10.35            | 4.05 - 6.70             |

&#x20;

DRAGEN分析文件可能根据所选分析选项，在预期输出文件夹大小基础上额外增加以下数据（单位：太字节TB）。文件大小估算基于单个flow cell、2×150循环测序运行。

| Flow cell类型 | **BAM (TB)** | CRAM (TB) | GVCF+VCF (TB) |
| ----------- | ------------ | --------- | ------------- |
| 1.5B        | 0.4          | 0.1       | <0.1          |
| 10B         | 2.5          | 1.0       | 0.2           |
| 25B         | 6.3          | 2.5       | 0.5           |

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\
\
\ <br>

|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        |
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