测序运行输出文件夹的近似大小
重要说明:本公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹(Output folder)大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽(Flow Cell)的测序运行,输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。
其他文件大小估算的注意事项
iSeq 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
MiniSeq和NextSeq 500/550(NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本)文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
MiSeq™ 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
NexSeq 1000/2000文件夹大小没有包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同,大小为25GB到120+GB。
HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小仅代表单个流动槽(Flow Cell)的文件夹大小。
Illumina推荐将iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000, HiSeq 1500/2500, HiSeq 3000/4000, HiSeq X等测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq Control Software要求把Output文件夹存储在网络位置。
iSeq 100
测序读长 | 文件夹大小(GB) |
2 x 150 bp | 1.5 - 2.5 |
MiniSeq
测序读长 | Output文件夹大小(GB) | ||
中通量 | 高通量 | 快速试剂盒 | |
2 x 150 bp | 2.3 - 2.6 | 7 - 8 | N/A |
2 x 75 bp | N/A | 6 - 8 | N/A |
1 x 100 bp | N/A | N/A | 2 |
1 x 75 bp | N/A | 2 - 4 | N/A |
MiSeq
v3 Chemistry | |
测序读长 | Output文件夹大小(GB) |
2 x 300 bp | 22 - 26 |
2 x 75 bp | 19 - 22 |
v2 Chemistry | ||
测序读长 | 测序试剂盒配置 | Output文件夹大小(GB) |
2 x 250 bp | Standard | 22 - 24 |
2 x 250 bp | Nano | 1.6 - 1.8 |
2 x 150 bp | Standard | 16 - 18 |
2 x 150 bp | Micro | 3 - 5 |
2 x 150 bp | Nano | 0.8 - 1.2 |
2 x 25 bp | Standard | 14 - 16 |
NextSeq 500/550
测序读长 | Output文件夹大小(GB) | |
中通量 | 高通量 | |
2 x 150 bp | 62 - 66 | 160 - 170 |
2 x 75 bp | 39 - 46 | 92 - 97 |
1 x 75 bp | N/A | 50 - 78 |
NextSeq 1000/2000
测序读长 | Output文件夹大小(GB) | ||
P1 | P2 | P3 | |
2 x 300 | 85 - 95 | 140 - 160 | N/A |
2 x 150 | 50 - 55 | 89 - 99 | 165 - 170 |
2 x 101 | 40 - 45 | 65 - 66 | 103 - 126 |
2 x 75 | 35 - 40 | 44 - 55 | N/A |
2 x 50 | N/A | N/A | N/A |
HiSeq 1000/1500/2000/2500
测序读长 | 高通量 TruSeq SBS v3 Output 文件夹大小(GB) | 高通量 SBS v4 Output 文件夹大小(GB) | HiSeq Rapid Run v2 Output文件夹大小(GB) |
2 x 250 bp | N/A | N/A | 80 - 100 |
2 x 125 bp | 295 - 310 | 190 - 210 | N/A |
2 x 100 bp | 225 | N/A | 55 - 60 |
2 x 50 bp | 133 | 77 - 83 | 32 - 36 |
HiSeq 3000/4000
测序读长 | Output文件夹大小(GB) |
2 x 150 bp | 560 |
2 x 75 bp | 290 |
2 x 25 bp | 80 |
HiSeq X
测序读长 | Output文件夹大小(GB) |
2 x 150 bp | 560 |
NovaSeq
测序读长 | SP 流动槽 Output文件夹大小(GB) | S1 流动槽 Output文件夹大小(GB) | S2 流动槽 Output文件夹大小(GB) | S4 流动槽 Output文件夹大小(GB) |
1 x 36 bp | 20 | N/A | N/A | 240 |
2 x 150 bp | 185 | 370 | 730 | 2190 |
2 x 250 bp | 400 | N/A | N/A | N/A |
这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes)为单位。
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