测序运行输出文件夹的近似大小

重要说明:本公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹(Output folder)大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽(Flow Cell)的测序运行,输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。

其他文件大小估算的注意事项

  • iSeq 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件

  • MiniSeq和NextSeq 500/550(NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本)文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件

  • MiSeq™ 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件

  • NexSeq 1000/2000文件夹大小没有包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同,大小为25GB到120+GB。

  • HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小仅代表单个流动槽(Flow Cell)的文件夹大小。

Illumina推荐将iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000, HiSeq 1500/2500, HiSeq 3000/4000, HiSeq X等测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq Control Software要求把Output文件夹存储在网络位置。

iSeq 100

测序读长

文件夹大小(GB)

2 x 150 bp

1.5 - 2.5

MiniSeq

测序读长

Output文件夹大小(GB)

中通量

高通量

快速试剂盒

2 x 150 bp

2.3 - 2.6

7 - 8

N/A

2 x 75 bp

N/A

6 - 8

N/A

1 x 100 bp

N/A

N/A

2

1 x 75 bp

N/A

2 - 4

N/A

MiSeq

v3 Chemistry

测序读长

Output文件夹大小(GB)

2 x 300 bp

22 - 26

2 x 75 bp

19 - 22

v2 Chemistry

测序读长

测序试剂盒配置

Output文件夹大小(GB)

2 x 250 bp

Standard

22 - 24

2 x 250 bp

Nano

1.6 - 1.8

2 x 150 bp

Standard

16 - 18

2 x 150 bp

Micro

3 - 5

2 x 150 bp

Nano

0.8 - 1.2

2 x 25 bp

Standard

14 - 16

NextSeq 500/550

测序读长

Output文件夹大小(GB)

中通量

高通量

2 x 150 bp

62 - 66

160 - 170

2 x 75 bp

39 - 46

92 - 97

1 x 75 bp

N/A

50 - 78

NextSeq 1000/2000

测序读长

Output文件夹大小(GB)

P1

P2

P3

2 x 300

85 - 95

140 - 160

N/A

2 x 150

50 - 55

89 - 99

165 - 170

2 x 101

40 - 45

65 - 66

103 - 126

2 x 75

35 - 40

44 - 55

N/A

2 x 50

N/A

N/A

N/A

HiSeq 1000/1500/2000/2500

测序读长

高通量 TruSeq SBS v3 Output 文件夹大小(GB)

高通量 SBS v4 Output 文件夹大小(GB)

HiSeq Rapid Run v2 Output文件夹大小(GB)

2 x 250 bp

N/A

N/A

80 - 100

2 x 125 bp

295 - 310

190 - 210

N/A

2 x 100 bp

225

N/A

55 - 60

2 x 50 bp

133

77 - 83

32 - 36

HiSeq 3000/4000

测序读长

Output文件夹大小(GB)

2 x 150 bp

560

2 x 75 bp

290

2 x 25 bp

80

HiSeq X

测序读长

Output文件夹大小(GB)

2 x 150 bp

560

NovaSeq

测序读长

SP 流动槽 Output文件夹大小(GB)

S1 流动槽 Output文件夹大小(GB)

S2 流动槽 Output文件夹大小(GB)

S4 流动槽 Output文件夹大小(GB)

1 x 36 bp

20

N/A

N/A

240

2 x 150 bp

185

370

730

2190

2 x 250 bp

400

N/A

N/A

N/A

这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes)为单位。

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