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测序运行输出文件夹的近似大小

重要说明:本公告中列出的测序输出文件夹大小仅应作为近似值使用。输出文件夹(Output folder)大小因原始簇密度和通过过滤器的簇的数量而有所不同。本文列出的每个平台的输出文件夹大小是基于双index的最佳簇密度情况下进行估算的。对于在非patterned流动槽(Flow Cell)的测序运行,输出文件夹的大小是基于PF值大于80%的情况下进行估算的。
其他文件大小估算的注意事项
  • iSeq 100文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • MiniSeq和NextSeq 500/550(NextSeq Control Software v4.0 以及以上版本)文件夹大小包含了Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • MiSeq™ 文件夹大小包含了MiSeq Reporter FASTQ 分析流程产生的FASTQ文件和MiSeq (MiSeq Control Software 3.1以及以上版本) Local Run Manager FASTQ分析流程产生的FASTQ文件
  • NexSeq 1000/2000文件夹大小没有包含本地分析结果。本地分析结果大小根据分析流程不同,大小为25GB到120+GB。
  • HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小不包含FASTQ文件。HiSeq 1500/2500,HiSeq 3000/4000,HiSeq X以及NovaSeq 6000 文件夹大小仅代表单个流动槽(Flow Cell)的文件夹大小。
Illumina推荐将iSeq 100, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000, HiSeq 1500/2500, HiSeq 3000/4000, HiSeq X等测序仪器的Output文件夹存储在网络位置。 NovaSeq Control Software要求把Output文件夹存储在网络位置。
iSeq 100
测序读长
文件夹大小(GB)
2 x 150 bp
1.5 - 2.5
MiniSeq
测序读长
Output文件夹大小(GB)
中通量
高通量
快速试剂盒
2 x 150 bp
2.3 - 2.6
7 - 8
N/A
2 x 75 bp
N/A
6 - 8
N/A
1 x 100 bp
N/A
N/A
2
1 x 75 bp
N/A
2 - 4
N/A
MiSeq
v3 Chemistry
测序读长
Output文件夹大小(GB)
2 x 300 bp
22 - 26
2 x 75 bp
19 - 22
v2 Chemistry
测序读长
测序试剂盒配置
Output文件夹大小(GB)
2 x 250 bp
Standard
22 - 24
2 x 250 bp
Nano
1.6 - 1.8
2 x 150 bp
Standard
16 - 18
2 x 150 bp
Micro
3 - 5
2 x 150 bp
Nano
0.8 - 1.2
2 x 25 bp
Standard
14 - 16
NextSeq 500/550
测序读长
Output文件夹大小(GB)
中通量
高通量
2 x 150 bp
62 - 66
160 - 170
2 x 75 bp
39 - 46
92 - 97
1 x 75 bp
N/A
50 - 78
NextSeq 1000/2000
测序读长
Output文件夹大小(GB)
P1
P2
P3
2 x 300
85 - 95
140 - 160
N/A
2 x 150
50 - 55
89 - 99
165 - 170
2 x 101
40 - 45
65 - 66
103 - 126
2 x 75
35 - 40
44 - 55
N/A
2 x 50
N/A
N/A
N/A
HiSeq 1000/1500/2000/2500
测序读长
高通量 TruSeq SBS v3 Output 文件夹大小(GB)
高通量 SBS v4 Output 文件夹大小(GB)
HiSeq Rapid Run v2 Output文件夹大小(GB)
2 x 250 bp
N/A
N/A
80 - 100
2 x 125 bp
295 - 310
190 - 210
N/A
2 x 100 bp
225
N/A
55 - 60
2 x 50 bp
133
77 - 83
32 - 36
HiSeq 3000/4000
测序读长
Output文件夹大小(GB)
2 x 150 bp
560
2 x 75 bp
290
2 x 25 bp
80
HiSeq X
测序读长
Output文件夹大小(GB)
2 x 150 bp
560
NovaSeq
测序读长
SP 流动槽 Output文件夹大小(GB)
S1 流动槽 Output文件夹大小(GB)
S2 流动槽 Output文件夹大小(GB)
S4 流动槽 Output文件夹大小(GB)
1 x 36 bp
20
N/A
N/A
240
2 x 150 bp
185
370
730
2190
2 x 250 bp
400
N/A
N/A
N/A
这些表中的输出文件夹大小以千兆字节(gigabytes)为单位。
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